Dans un monde en proie à la haine et aux préjugés, les mutants sont exclus, méprisés et craints par tous ceux qui ne peuvent accepter leurs différences. Le professeur Charles Xavier dirige une école pour ces êtres à part. Parmi eux, Cyclone, Tornade, Wolverine et Jean Grey forment l'équipe des X-Men. Ils devront affronter le redoutable Magneto, mutant surpuissant qui rêve d'anéantir l'espèce humaine...